Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp20P57748 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp20P57748 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp20P57748 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp20P57748 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms