Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1P56716 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rp1P56716 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1P56716 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp1P56716 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rp1P56716 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp1P56716 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp1P56716 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp1P56716 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp1P56716 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms