Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TdgP56581 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TdgP56581 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TdgP56581 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TdgP56581 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TdgP56581 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TdgP56581 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TdgP56581 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TdgP56581 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TdgP56581 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TdgP56581 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TdgP56581 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TdgP56581 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TdgP56581 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TdgP56581 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TdgP56581 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TdgP56581 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TdgP56581 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TdgP56581 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TdgP56581 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TdgP56581 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TdgP56581 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TdgP56581 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms