Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4aP56371 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab4aP56371 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab4aP56371 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms