Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GemP55041 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GemP55041 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GemP55041 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GemP55041 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GemP55041 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GemP55041 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GemP55041 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GemP55041 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GemP55041 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GemP55041 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GemP55041 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GemP55041 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GemP55041 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GemP55041 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GemP55041 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GemP55041 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GemP55041 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GemP55041 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GemP55041 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GemP55041 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GemP55041 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms