Protein–RNA interactions for Protein: P54841

Mafb, Transcription factor MafB, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MafbP54841 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MafbP54841 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MafbP54841 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MafbP54841 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MafbP54841 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MafbP54841 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MafbP54841 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MafbP54841 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MafbP54841 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MafbP54841 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MafbP54841 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MafbP54841 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MafbP54841 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MafbP54841 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MafbP54841 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MafbP54841 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MafbP54841 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MafbP54841 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MafbP54841 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MafbP54841 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MafbP54841 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MafbP54841 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MafbP54841 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MafbP54841 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MafbP54841 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MafbP54841 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MafbP54841 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MafbP54841 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MafbP54841 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MafbP54841 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MafbP54841 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MafbP54841 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MafbP54841 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MafbP54841 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MafbP54841 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MafbP54841 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MafbP54841 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MafbP54841 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MafbP54841 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MafbP54841 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MafbP54841 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MafbP54841 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MafbP54841 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms