Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ephb4P54761 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb4P54761 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb4P54761 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms