Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Faf1P54731 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Faf1P54731 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms