Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PctpP53808 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PctpP53808 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PctpP53808 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PctpP53808 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PctpP53808 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PctpP53808 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PctpP53808 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PctpP53808 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PctpP53808 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PctpP53808 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PctpP53808 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PctpP53808 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PctpP53808 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PctpP53808 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PctpP53808 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PctpP53808 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PctpP53808 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PctpP53808 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PctpP53808 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PctpP53808 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PctpP53808 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PctpP53808 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PctpP53808 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PctpP53808 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PctpP53808 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms