Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec1P51908 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec1P51908 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apobec1P51908 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms