Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc1a1P51906 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms