Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr5P51682 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccr5P51682 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms