Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XpcP51612 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XpcP51612 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XpcP51612 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XpcP51612 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XpcP51612 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XpcP51612 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XpcP51612 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XpcP51612 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XpcP51612 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XpcP51612 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XpcP51612 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XpcP51612 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XpcP51612 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
XpcP51612 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XpcP51612 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XpcP51612 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XpcP51612 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XpcP51612 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XpcP51612 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XpcP51612 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XpcP51612 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XpcP51612 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XpcP51612 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XpcP51612 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XpcP51612 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XpcP51612 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XpcP51612 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XpcP51612 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XpcP51612 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XpcP51612 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XpcP51612 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XpcP51612 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XpcP51612 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XpcP51612 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms