Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RoraP51448 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RoraP51448 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RoraP51448 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RoraP51448 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RoraP51448 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RoraP51448 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RoraP51448 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RoraP51448 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RoraP51448 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RoraP51448 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RoraP51448 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RoraP51448 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RoraP51448 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RoraP51448 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RoraP51448 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RoraP51448 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RoraP51448 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RoraP51448 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RoraP51448 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RoraP51448 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RoraP51448 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RoraP51448 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RoraP51448 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RoraP51448 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RoraP51448 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RoraP51448 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RoraP51448 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RoraP51448 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RoraP51448 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RoraP51448 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RoraP51448 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms