Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa13P50711 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa13P50711 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms