Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl5P50228 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxcl5P50228 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms