Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc13P50207 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc13P50207 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc13P50207 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms