Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox8bP48772 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms