Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptx3P48759 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx3P48759 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx3P48759 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms