Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GastP48757 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GastP48757 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GastP48757 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GastP48757 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GastP48757 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GastP48757 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GastP48757 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GastP48757 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GastP48757 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GastP48757 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GastP48757 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GastP48757 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GastP48757 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GastP48757 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GastP48757 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GastP48757 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GastP48757 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GastP48757 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GastP48757 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms