Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edn3P48299 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms