Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl11P48298 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms