Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gli1P47806 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gli1P47806 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gli1P47806 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms