Protein–RNA interactions for Protein: P47757

Capzb, F-actin-capping protein subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CapzbP47757 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CapzbP47757 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CapzbP47757 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CapzbP47757 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CapzbP47757 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms