Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic1P46684 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic1P46684 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic1P46684 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zic1P46684 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zic1P46684 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic1P46684 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zic1P46684 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic1P46684 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic1P46684 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zic1P46684 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms