Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf4P43488 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf4P43488 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms