Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr3P43300 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr3P43300 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Egr3P43300 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Egr3P43300 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms