Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtgfrP43117 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtgfrP43117 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms