Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec3bP43025 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clec3bP43025 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec3bP43025 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms