Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox6a1P43024 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox6a1P43024 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox6a1P43024 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms