Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx1-2P42580 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx1-2P42580 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-2P42580 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms