Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VhlP40338 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VhlP40338 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VhlP40338 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VhlP40338 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VhlP40338 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VhlP40338 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VhlP40338 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VhlP40338 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VhlP40338 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VhlP40338 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VhlP40338 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VhlP40338 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VhlP40338 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VhlP40338 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VhlP40338 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VhlP40338 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VhlP40338 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VhlP40338 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VhlP40338 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VhlP40338 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VhlP40338 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VhlP40338 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VhlP40338 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VhlP40338 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VhlP40338 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VhlP40338 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VhlP40338 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VhlP40338 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VhlP40338 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VhlP40338 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VhlP40338 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VhlP40338 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VhlP40338 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VhlP40338 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VhlP40338 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VhlP40338 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VhlP40338 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VhlP40338 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VhlP40338 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VhlP40338 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms