Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col18a1P39061 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col18a1P39061 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col18a1P39061 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col18a1P39061 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms