Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PpargP37238 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PpargP37238 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PpargP37238 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PpargP37238 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PpargP37238 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PpargP37238 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PpargP37238 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PpargP37238 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpargP37238 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpargP37238 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpargP37238 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpargP37238 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpargP37238 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpargP37238 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpargP37238 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpargP37238 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpargP37238 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpargP37238 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpargP37238 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpargP37238 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpargP37238 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpargP37238 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PpargP37238 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpargP37238 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpargP37238 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms