Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pola2P33611 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola2P33611 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola2P33611 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola2P33611 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms