Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AregP31955 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AregP31955 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AregP31955 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AregP31955 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AregP31955 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AregP31955 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AregP31955 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AregP31955 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AregP31955 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AregP31955 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AregP31955 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AregP31955 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AregP31955 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AregP31955 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AregP31955 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AregP31955 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AregP31955 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AregP31955 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AregP31955 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AregP31955 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AregP31955 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AregP31955 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms