Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa4P31532 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa4P31532 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Saa4P31532 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Saa4P31532 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms