Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gsx2P31316 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsx2P31316 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms