Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnd3P30282 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnd3P30282 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnd3P30282 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms