Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HexaP29416 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HexaP29416 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HexaP29416 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HexaP29416 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HexaP29416 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HexaP29416 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HexaP29416 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HexaP29416 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HexaP29416 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HexaP29416 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HexaP29416 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HexaP29416 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HexaP29416 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HexaP29416 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HexaP29416 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HexaP29416 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HexaP29416 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HexaP29416 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HexaP29416 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HexaP29416 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HexaP29416 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HexaP29416 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HexaP29416 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms