Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1P29341 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1P29341 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms