Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha3P29319 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha3P29319 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha3P29319 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epha3P29319 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha3P29319 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha3P29319 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms