Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa3P28310 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa3P28310 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa3P28310 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa3P28310 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa3P28310 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Defa3P28310 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa3P28310 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa3P28310 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa3P28310 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa3P28310 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa3P28310 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa3P28310 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa3P28310 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa3P28310 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa3P28310 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa3P28310 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa3P28310 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa3P28310 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa3P28310 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa3P28310 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms