Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aco1P28271 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aco1P28271 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aco1P28271 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms