Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb1P28230 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb1P28230 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms