Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl6P27784 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl6P27784 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms