Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CremP27699 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CremP27699 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CremP27699 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CremP27699 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CremP27699 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CremP27699 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CremP27699 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CremP27699 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CremP27699 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CremP27699 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CremP27699 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CremP27699 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CremP27699 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CremP27699 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CremP27699 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CremP27699 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CremP27699 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CremP27699 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CremP27699 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CremP27699 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CremP27699 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CremP27699 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CremP27699 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CremP27699 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CremP27699 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CremP27699 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CremP27699 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CremP27699 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CremP27699 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CremP27699 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CremP27699 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CremP27699 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CremP27699 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CremP27699 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms