Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6aP27664 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6aP27664 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms