Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afxP27661 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afxP27661 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afxP27661 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms