Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PdgfraP26618 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PdgfraP26618 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms